La corporación NVIDIA de Estados Unidos premió a los investigadores Dres. Diego Masone y
Diego M. Bustos del Laboratorio de Integración de Señales Celulares del Instituto de Histología y
Embriología de Mendoza (IHEM, CONICET-UNCuyo) con una unidad de procesamiento para cálculos científicos de
altas prestaciones.
Los científicos Masone y Bustos realizan simulaciones computacionales para estudiar sistemas
biológicos de interés en biomedicina. En particular, investigan las interacciones entre proteínas
humanas y sus afinidades por diferentes moléculas, como los fármacos.
El equipamiento donado
por la corporación NVIDIA consiste en unidad GPU-Tesla-K40 con un rendimiento
pico de operaciones en coma flotante de doble precisión de 1,43 Tflops. Esta tecnología de frontera
permite simular modelos científicos de gran tamaño en tiempos del orden de 10 veces más cortos en
relación a los clásicos procesadores CPU.
Unidad GPU-Tesla-K40 de NVIDIALa bioinformática es un campo multidisciplinario que cubre un vasto y diverso grupo de disciplinas
derivadas de la biología, las ciencias de la computación, la física, la química y la ingeniera. Las
simulaciones computacionales son costosas y requieren grandes cantidades de procesadores y horas
de cálculo y por ello, en el ámbito científico, la tecnología GPU (graphic processing unit) se ha
vuelto indispensable en los centros de supercomputación.
Aunque no se trate de una estrategia infalible, las simulaciones computacionales permiten reducir
significativamente los tiempos de diseño y prueba de los nuevos fármacos, lo que repercute en
mejores y más específicos medicamentos.
De esta forma, el estudio a nivel molecular de las
interacciones entre proteínas y ligandos sienta las bases del desarrollo tecnológico para el diseño de
mejores fármacos y su transporte más efectivo. El mejoramiento de las infraestructuras de
supercálculo, permite entonces a la bioinformática colaborar con el diseño racional de
medicamentos más seguros y eficientes.
Para leer más:
https://sites.google.com/site/integraciondesenalescelulares/homeFuente: Inv. Diego Bustos